Премии конкурса:

Ученый Совет устанавливает десять премий по каждому из четырех научных направлений (всего 40 премий):

одна первая премия	10000 руб.	(всего 4 первых премий, одна из которых может быть названа жюри "гран-при")
три вторых премии	по 6000 руб. каждая	(всего 12 вторых премий)
пять третьих премий	по 4000 руб. каждая	(всего 20 третьих премий)
одна премия для молодых ученых	по 4000 руб. каждая	(всего четыре премии)

В случае, если победителем окажется работа группы авторов, премия распределяется между авторами - сотрудниками Института.

Премия для молодых ученых может быть присуждена за работу, выполненную в соавторстве, однако премия выплачивается только автору работы, возраст которого не превышает 33 года на конец 2001 г.